uniprot数据库分哪几个层次(uniprot的注释信息怎么查看)

作者:李小华      发布时间:2021-09-06      浏览量:87892
uniprot数据库分哪几个层次数据库设计可以分为概念结构设计、逻辑结构设计和物理结构设计三个阶段。  (1)概念结构设计。这是数据库设计的第一个阶段,在管理信息系统的分析阶段,已经得到了系统的数据流程图和数据字典,现在要结合数据规范化的理

uniprot数据库分哪几个层次


数据库设计可以分为概念结构设计、逻辑结构设计和物理结构设计三个阶段。
  (1)概念结构设计。这是数据库设计的第一个阶段,在管理信息系统的分析阶段,已经得到了系统的数据流程图和数据字典,现在要结合数据规范化的理论,用一种数据模型将用户的数据需求明确地表示出来。
  概念数据模型是面向问题的模型,反映了用户的现实工作环境,是与数据库的具体实现技术无关的。建立系统概念数据模型的过程叫做概念结构设计。
  (2)逻辑结构设计。根据已经建立的概念数据模型,以及所采用的某个数据库管理系统软件的数据模型特

uniprot的注释信息怎么查看


UniProtKB/TrEMBL收录的则是高质量的经计算机分析后进行自动注释和分类的序列。计算机辅助注释使用的是Spearmint规则,而人工注释依据的则是蛋白质家族规则,包括HAMAP家族规则(HAMAP family rules)、RuleBase规则、PIRSF分类命名规则以及位点规则。
UniProtKB/TrEMBL还收录了所有EMBL-Bank/ GenBank/DDBJ核酸序列数据库中的编码序列的翻译后蛋白质序列和来自拟南芥信息资源库(TAIR)、SGD和人类Ensembl数据库中序列

在pdb 数据库上下载蛋白质


你直接在PBD主页上的pbd ID or text 里输入你的蛋白ID,也就是1SA1和1SA0,就能查到你要的蛋白质了。蛋白ID旁边有个Download Files,点击后选择你要下载的文件格式即可下载。

蛋白质数据库是指包括蛋白质信息的数据库。常用的蛋白质数据库有很多,其中uniprot被认为收录最广泛和注释信息最全面的蛋白质数据库。uniprot下包括swiss-prot、trembl和pir-psd,详见uniprot_百度百科。其他的蛋白数据库有pdb(protein data

请问有什么资料可以看懂PDB数据库中显示的序列,那些图跟文字都代表什么,希望可以图文并茂,谢谢啦


dfshesh

蛋白质数据库是指包括蛋白质信息的数据库。常用的蛋白质数据库有很多,其中uniprot被认为收录最广泛和注释信息最全面的蛋白质数据库。uniprot下包括swiss-prot、trembl和pir-psd,详见uniprot_百度百科。其他的蛋白数据库有pdb(protein data bank,简称pdb,开始建立于1971年)等。国内也有些如由上海生物信息技术研究中心下属的生物信息科学数据共享平台建立及维护的sdspb等。

不了解~